Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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