Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zbtb38Q3LR78 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Zbtb38Q3LR78 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Zbtb38Q3LR78 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Zbtb38Q3LR78 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms