Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Tead4-203ENSMUST00000130454 1718 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm20945-201ENSMUST00000178122 1145 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Zfp422-ps-201ENSMUST00000182230 706 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Ddias-201ENSMUST00000032877 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm33180-201ENSMUST00000217109 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm33024-201ENSMUST00000203143 633 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Fuom-202ENSMUST00000120034 680 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm8817-201ENSMUST00000126769 693 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm25145-201ENSMUST00000177640 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Rad52-212ENSMUST00000162461 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms