Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GscQ02591 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GscQ02591 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms