Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms