Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csrnp3P59055 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Slc25a44-201ENSMUST00000057935 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms