Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms