Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Chd1P40201 Gm2324-201ENSMUST00000187464 662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Chd1P40201 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Chd1P40201 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Chd1P40201 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Chd1P40201 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Chd1P40201 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm8606-201ENSMUST00000121482 888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Chd1P40201 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 CT030657.4-201ENSMUST00000222177 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Chd1P40201 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Rhox12-202ENSMUST00000115146 561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm12248-201ENSMUST00000137124 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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