Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RxraP28700 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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