Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18533 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18533 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms