Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms