Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms