Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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H2-AaP01910 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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H2-AaP01910 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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H2-AaP01910 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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H2-AaP01910 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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