Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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