Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms