Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms