Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Fndc8Q9D2H8 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc8Q9D2H8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms