Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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