Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Csnka2ipQ8CH19 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Csnka2ipQ8CH19 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Csnka2ipQ8CH19 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Csnka2ipQ8CH19 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Csnka2ipQ8CH19 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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