Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh13Q8CEE7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms