Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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