Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 1700125H20Rik-201ENSMUST00000018623 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms