Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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