Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms