Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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