Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Deup1-203ENSMUST00000115593 3019 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms