Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Irf5P56477 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Irf5P56477 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Irf5P56477 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Irf5P56477 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf5P56477 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Irf5P56477 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Irf5P56477 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Irf5P56477 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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Irf5P56477 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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