Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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LtbrP50284 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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LtbrP50284 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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LtbrP50284 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LtbrP50284 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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LtbrP50284 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LtbrP50284 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LtbrP50284 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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LtbrP50284 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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LtbrP50284 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LtbrP50284 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms