Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa-rs1P17533 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa-rs1P17533 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa-rs1P17533 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa-rs1P17533 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa-rs1P17533 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa-rs1P17533 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa-rs1P17533 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa-rs1P17533 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa-rs1P17533 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa-rs1P17533 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa-rs1P17533 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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