Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfr914-202ENSMUST00000217057 4948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms