Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P10404 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P10404 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
P10404 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
P10404 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P10404 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
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P10404 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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P10404 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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P10404 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P10404 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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P10404 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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P10404 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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P10404 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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P10404 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P10404 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P10404 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P10404 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
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P10404 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
P10404 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P10404 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P10404 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P10404 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
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