Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms