Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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