Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf6Q9DBU5 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf6Q9DBU5 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf6Q9DBU5 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf6Q9DBU5 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf6Q9DBU5 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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