Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms