Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Zbed3Q9D0L1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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