Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddx28Q9CWT6 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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