Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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