Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms