Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm6463-201ENSMUST00000182090 966 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NischQ80TM9 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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