Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms