Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sec31aQ3UPL0 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms