Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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Ttc39dQ0VF76 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Ttc39dQ0VF76 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
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Ttc39dQ0VF76 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
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Ttc39dQ0VF76 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Ttc39dQ0VF76 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Ttc39dQ0VF76 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Ttc39dQ0VF76 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms