Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttc21bQ0HA38 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttc21bQ0HA38 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttc21bQ0HA38 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttc21bQ0HA38 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttc21bQ0HA38 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttc21bQ0HA38 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ttc21bQ0HA38 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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