Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Stx1bP61264 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms