Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Irf5P56477 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf5P56477 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Irf5P56477 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf5P56477 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Irf5P56477 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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