Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LtbrP50284 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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LtbrP50284 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbrP50284 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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