Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VdrP48281 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VdrP48281 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VdrP48281 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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