Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm11401-201ENSMUST00000117212 344 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm8704-201ENSMUST00000197181 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm43551-201ENSMUST00000197221 440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gnpnat1-202ENSMUST00000226276 710 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Mettl18-201ENSMUST00000045694 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Snap25-201ENSMUST00000028727 2116 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm5092-201ENSMUST00000188185 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm14138-201ENSMUST00000122061 745 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm15841-201ENSMUST00000160540 517 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Cnih3-203ENSMUST00000162685 602 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm9825-201ENSMUST00000178598 843 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm45521-201ENSMUST00000211339 676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Etfbkmt-202ENSMUST00000111547 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Fuom-202ENSMUST00000120034 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm13631-201ENSMUST00000140978 654 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Rit1-207ENSMUST00000172252 820 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Cox4i2-202ENSMUST00000109821 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm12188-201ENSMUST00000117387 310 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm3617-201ENSMUST00000173076 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm29388-201ENSMUST00000190718 284 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm37804-201ENSMUST00000192206 547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 AC124173.1-201ENSMUST00000223701 189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms