Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CebpbP28033 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms